地理信息系统（GIS）是一种将空间和属性数据相结合的计算机技术，用于采集、存储、管理、分析和展示地理数据。
GIS系统的功能可按照不同的层次进行划分，主要包括数据采集与输入、数据管理与存储、空间分析与处理、地图制图与输出等几个方面。
数据采集与输入是GIS系统的基础，主要包括数据源的选择、数据获取和数据录入等环节。数据源可以来自卫星遥感、GPS定位、地面测量等各种方式，而数据获取则需要借助于相应的硬件设备和软件工具。数据录入则是将数据转化为计算机可识别的格式，如矢量、栅格或拓扑数据等。
数据管理与存储是GIS系统中非常重要的一环，其主要任务是对采集到的数据进行整理、组织、存储和更新，以便于后续的分析和应用。数据管理包括数据的标准化、清理、拓扑建模等过程，而数据存储则根据具体需求选择合适的数据库或文件格式。常见的数据库管理系统有Oracle、MySQL和ESRI Geodatabase等。
空间分析与处理是GIS系统中的核心功能，其主要用于对地理数据进行处理、分析和模拟，以提取出有用的空间信息和规律。空间分析可以包括距离分析、叠加分析、网络分析等多种形式，通过对地理数据的统计、建模和推理，实现对地理现象的深入理解和预测。空间分析结果可以应用于城市规划、资源管理、环境保护等领域。
地图制图与输出是GIS系统的最终环节，其主要任务是将处理好的地理数据以地图形式展示出来，便于人们阅读和理解。地图制图需要考虑到颜色、符号、比例尺、标注等多种要素，同时还可以根据需求进行专题制图和动态制图。地图输出可以是纸质地图、电子地图或WebGIS等多种形式，方便用户进行查询、浏览和交互。
综上所述，GIS系统的功能层次包括数据采集与输入、数据管理与存储、空间分析与处理、地图制图与输出等几个方面，每个层次都具有各自的特点和重要性。在实际应用中，这些功能层次相互协调，融合在一起，为我们提供了丰富、全面、高效的地理信息服务。